近十年來，西洞庭湖自然保護區一直與世界自然基金會（WWF）長沙野外辦公室合作，開展濕地生態環境保護，使西洞庭湖自然保護區的生態環境保護工作邁上了一個新臺階。
2000年，西洞庭湖自然保護區在WWF長沙野外辦公室的資助下，建立了我國第一個濕地生態環境保護宣傳教育中心，并建設了該宣教中心的魚類、鳥類標本陳列館。多年來，保護區與WWF長沙野外辦公室先后在西洞庭湖區開展了“退田還湖、恢復濕地”，社區共管，促進生態旅游，發展生態農業（包括有機蔬菜和有機魚）等示范項目，均收到了良好的社會效果，其中，青山垸“退田還湖、恢復濕地”，“社區共管”項目于2005年被評為全國十佳可持續發展案例，青山垸有機魚生產于2006年獲得了國家環�？偩帜暇﹪h有機認證中心OFDC的有機認證，2008年“青山垸社區共管”模式在國、內外進行了廣泛推廣。