體系文件在試運行的過程中總是不可避免地要出現一些問題，實施HSE監督是保證體系正常運行的必要手段，實踐是檢驗真理的唯一標準；這一方面要依靠全體員工的積極參與，員工應將實踐中出現的偏離標準的現象及改進意見及時反映到有關部門，以便及時采取糾正預防措施。另一方面通過有組織、有計劃的內部審核和管理評審發現和解決問題。

　　按照慣例，HSE管理體系試運行階段至少要保持3個月以上，并且必須進行兩次系統的內部審核和一次管理評審，方可申請體系認證。內部審核可以自我診斷和評審企業的HSE管理體系方面所取得的成效，還有那些需求和不足，因而是進一步改善體系有強有力手段。內部審核是檢查與確認體系各要素的實施效果是否按照計劃有效實現，并對體系的運行是否達到規定的目標所做的系統的、獨立的檢查和評價。在外部審核發現不符合項之前便能采取糾正行為，將有助于企業順利通過第三方認證，內部審核對任何企業和部門都具必要性，也是管理體系標準的內在要求。

　　對體系試運行中暴露出來的問題，如體系設計不周、項目不全等問題進行協調，加以改進。糾正措施是否落實、是否有效等問題應該指定有關部門進行跟蹤、監督和驗證。管理評審是企業的最高管理者親自主持的、對體系現狀是否有效地適應企業承諾和方針要求，以及體系的運行環境出現變化后確定新目標是否繼續適應等所作的綜合評價。在式運行階段，企業對其HSE管理體系進行管理評審，可以就體系內審結果、方針、目標貫徹落實情況，與體系文件的符合性和有效性進行評定，提出體系改進的措施。