近年來，重慶市貫徹科學發展觀加強環境保護，以主城區大氣污染防治和三峽庫區水環境保護為重點，建立四項工作機制，推進實施藍天、碧水、綠地、寧靜“四大行動”，努力改善人居環境。

　　一是堅持科學決策機制。重慶市委、市政府出臺了《關于建設宜居重慶的決定》、《關于加強環境保護若干問題的決定》和《關于進一步建立和完善環境保護長效監管機制的通知》。重慶市委常委會、市政府常務會定期研究環保重大問題。歷任市委書記、市長都強調“改善重慶環境質量要多付出超過其他城市多倍的努力，需要有超前措施和系列工程”。薄熙來書記批示“一定要重視環保”并主持市委常委會審議黨政一把手環保實績考核結果。王鴻舉市長要求“區縣黨政領導要像背GDP那樣對轄區污染物排放量了如指掌”并親任市環委會主任，30個市級部門一把手為市環委會成員，每年開會研究工作。建立了“目標任務明確、系統論證評估、廣泛征求意見、院士專家論證、政府審議印發”的科學決策機制，完善了“市環委會決定、市調度會研究、專題會議推進、現場會議督辦、聯絡員會協商”的會議工作機制。

　　二是建立目標責任機制。建立了黨委、政府主要領導親自抓，分管領導具體抓，各區縣和市級部門層層落實的目標責任制。重慶市委、市政府每年將環保目標任務和突出環境問題分解下達到區縣黨委、政府和市級部門，并納入區縣經濟社會發展綜合考核和黨政一把手環保實績考核內容。初步建立了以推進“四大行動”為主的環境質量改善機制，以“嚴查環境違法行為保障群眾健康環保專項行動”為主的環境執法部門聯動機制，以落實黨政一把手“親自抓、負總責”為主的環保實績考核機制，以暢通“12369環保舉報受理中心”為主的環保公眾監督機制。形成了“黨委政府領導、人大政協監督、環保部門組織、相關部門履職、社會公眾參與”的齊抓共管機制，完善了“職責分工明確、目標任務量化、項目措施落實、監督考核逗硬、獎勵懲處兌現”的目標責任機制。

　　三是健全工作保障機制。重慶市政府每年在排污費之外再安排5000萬元用于污染防治和生態建設并以此為基數每年遞增10%，直轄以來全市投資生態環保約600億元，市財政近3年投入生態環保資金174億元，“四大行動”每年投入近50億元。制定了四大行動督查、實施方案編制、環境質量預警與應急3個工作流程圖。建立了“組織保障有力、制度保障可靠、項目保障落實、執法保障充分、人員保障到位”的組織與制度保障機制，形成了“完善政策配套、開展建章立制、堅持技術創新、保障資金投入、強化監測能力”的政策與投入保障機制。

　　四是完善監督考核機制。2004年起3任分管副市長均堅持每季度召開四大行動調度會，檢查工作進展，研究解決問題。成立了重慶市政府督查室主任為組長的市政府藍天行動督查組，從重慶市監察局、市環保局、市建委、市市政委抽調專人集中辦公，開展日常巡查和督辦問題，制定了《重慶市主城空氣質量預警與應急措施暫行規定》和《重慶市環保四大行動督查工作暫行辦法》。各區也成立機構開展聯合執法、交叉檢查、案件移送、掛牌督辦等。初步建立黨政一把手環保實績考核、年度目標任務考核、民心工程考核、環境突出問題考核等制度。形成了“實行政務督查、開展行政監察、落實責任追究、公布投訴電話、定期監督通報”的政務監督機制，建立了“專人巡查、日常督辦、媒體曝光、掛牌督辦、限期整改”的污染源督辦機制，完善了“預警預報、應急響應、信息共享、監控嚴密”的預警應急機制。