體系建立之初，很大程度上是滿足標準的要求，但很多企業實際的要求和客戶的要求是高于標準的要求。在很多情況下就要求把體系推進工作和公司的精益生產管理及持續改進活動結合起來。
精益生產管理的目的是維持高效率生產活動，追求最恰當節拍，最少量消費，最優秀品質。體系工作要融入精益生產管理中，要將文件化管理體制在精益生產管理中建立和維護下來，要將精益生產管理納入管理體系之中。用體系管理思路來管理精益生產，做好文件標準化、過程流程化、衡量數字化。體系管理關注過程控制，對于無設計職責的企業，首當其沖應特別關注制造過程。體系工作為精益生產提供管理思路，精益生產為制造現場有效管理提供具體的操作方法。
在體系建立之后體系推進就是體系的改進，而這往往是容易被忽視的。凡是涉及到體系和體制改進，其影響力大于一般的改進。體系改進應使重要的、未管理的過程被管理起來；應使不合理的流程趨于合理；若需要，體系改進應該是職責和資源的再分配。